Pepermuntolie heeft weinig bijwerkingen. Wel moet u er rekening mee houden dat pepermuntolie een bijzonder sterke stof is. Bijwerkingen ontstaan dan ook vooral als u teveel van de stof gebruikt. Bekende bijwerkingen bij een te hoge dosering pepermuntolie zijn duizeligheid, misselijkheid, brandende ogen en bij inname brandend maagzuur en een brandend spijsverteringskanaal. Zoals met bijna alle sterke stoffen raden we aan pepermuntolie niet in contact te laten komen met ogen, genitaliën en andere kwetsbare lichaamsdelen. Ook raden we aan kinderen niet in contact met pepermuntolie te laten komen en de stof te behandelen zoals u schoonmaakmiddelen en medicijnen behandelt: houd het achter slot en grendel! Als de pepermuntolie toch in contact met ogen of andere kwetsbare lichaamsdelen is gekomen raden wij aan te spoelen met heel veel water en als de pijn niet over gaat binnen enkele uren een dokter raad te plegen.

Pepermuntolie kunt u beter niet gebruiken als u last heeft van problemen met lever, maag of galblaas.